Mokykla įkurta 1889 m. Ketvergiuose pas vietinį ūkininką – lietuvininką[1], ten, kur baigiasi Kalvių žvyro karjero tvenkinys.

1897 m. valstybės lėšomis  pastatyta nauja mokykla. – dabartinis senasis mokyklos pastatas.

   Joje įsteigtos keturios klasės. Mokykloje dirbo tik vienas mokytojas. Pastatas buvo pritaikytas mokyklai ir mokytojui su šeima gyventi. 1929 m. mokėsi 48 mokiniai, iš jų  42 lietuviai ir tik 6 vokiečių tautybės. Mokė vokiečių kalba, nes mokytojas nemokėjo lietuviškai. Buvo numatyta mokyti ir lietuvių kalba.
    Augant mokinių skaičiui, 1949 m. mokykla tapo septynmete ir buvo įkurta penktoji klasė. Kadangi mokinių buvo daug, penkta klasė įkurdinama Toleikių kaime. Patalpa  išnuomota Vorlico name. Tačiau 1950 m. penktokai perkelti  į Ketvergius.

1962 m. tampa aštuonmete, o 1967 m., didėjant mokinių skaičiui, pastatytas mokyklos priestatas.

1989 m. mokykla tampa devynmete.

   1999 m. įgyja dešimtmetės statusą.

2004 m. pastatytas antrasis mokyklos priestatas. Įrengiama priešmokyklinio ugdymo klasė.

2007 m. rugsėjo pirmąją Ketvergių pagrindinės mokyklos bendruomenė šventė ne tik mokslų metų pradžią, bet ir naujos sporto salės atidarymą. Šiame mokyklos  priestate įrengta ne tik sporto salė, bet ir papildomos trys klasės, buitinės patalpos, kuriose yra persirengimo kambariai su dušais


[1] Taip buvo vadinami Mažosios Lietuvos gyventojai nuo XVI amžiaus.